《太平天国史纲》 商务印书馆1937年版。

《湘军新志》 商务印书馆1939年版。

《湘军兵志》（改写本） 中华书局1984年版。

《捻军的运动战》 商务印书馆1939年版；商务印书馆1950年再版；商务印书馆1955年修订版，更名为《太平天国新军的运动战》。

《洪秀全金田起义前年谱》 （与陈婉芬合著） 正中书局1943年版。

《太平天国史丛考》 正中书局1943年版。

《天地会文献录》 正中书局1943年版。

《洪秀全》 重庆胜利出版社1944年版。

《师门辱教记》 桂林建设书店1944年版；958年胡适改书名为《师门五年记》，出资重印，作赠送朋友之用。

《师门五年记·胡适琐记》 三联（香港）书店1994年版；三联（北京）书店1995年版（文字稍有增加）；三联（北京）书店1998年版（增补本）。

《绿营兵志》 商务印书馆1945年版；中华书局1984年版（修改本）。

《太平天国金石录》 正中书局1948年版。

《太平天国史考证集》 独立出版社1948年版。

《太平天国广西首义志》 六艺书局1948年版。

《太平天国的理想国》 商务印书馆1950年版。

《太平天国史辨伪集》 商务印书馆1950年版。

《平天国史稿》 开明书店1951年版；中华书局1955年版（改写本）；中华书局1957年版（增订本）。

《太平天国史》 中华书局1991年版。

《李秀成自传原稿笺证》 开明书店1951年版；中华书局1954年版（修改本）；中华书局1957年版（增订本）。

《李秀成自述原稿注》 中华书局1982年版；中国社会科学出版社1995年版（增补本）。

《忠王李秀成传》 江苏人民出版社1954年版。

《清代乾嘉道咸同光六朝人口统计》（附刊于经济研究所编的《中国近代经济史统计资料选辑》一书内） 科学出版社1955年版。

《太平天国史记载订谬集》（《太平天国史论文集》第一集） 三联书店1955年版；三联书店1985年第二版。

《太平天国史事考》（《太平天国史论文集》第二集） 三联书店1955年版；三联书店1979年第二版；三联书店1985年第三版（修改本）。

《太平天国史料辨伪集》（《太平天国史论文集》第三集） 三联书店1955年版；三联书店1985年第二版。

《天历考及天历与夏历公历对照表》（《太平天国史论文集》第四集） 三联书店1955年版。

《太平天国史料考释集》（《太平天国史论文集》第五集） 三联书店1956年版。

《太平天国文物图释》（《太平天国史论文集》第六集） 三联书店1956年版；三联书店1985年第二版。

《太平天国史迹调查集》（《太平天国史论文集》第七集） 三联书店1958年版；三联书店1979年再版。

《太平天国史丛考甲集》（《太平天国史论文集》第八集） 三联书店1981年版；三联书店1985年第二版。

《太平天国史丛考乙集》（《太平天国史论文集》第九集） 三联书店1995年版。

《太平天国史丛考丙集》（《太平天国史论文集》第十集） 三联书店1995年版。

《太平天国史画》（《罗尔纲先生设计和指导，由南京大学美术系于1950年和1952年绘制，后经南京市文物管理委员会美术组和江苏人民出版社美术编辑室改绘一部分） 江苏人民出版社1956年版。

《太平天国文选》 上海人民出版社1956年版。

《忠王自传原稿考证与论考据》 科学出版社1958年版。

《太平天国诗文选》 中华书局上海编辑所1960年版。

《困学集》 中华书局1986年版。

《困学丛书》 广西人民出版社1989年版。

《水浒传原本》 贵州人民出版社1989年版。

《生涯六记》 贵州人民出版社1991年版。

《生涯再忆》 山西人民出版社1997年版。

《我童年的教育·抗病记》 贵州人民出版社1991年版。

《四季诗》 贵州人民出版社1991年版。

《水浒传原本和著者研究》 江苏古籍出版社1992年版。

《太平天国散佚文献勾沉录》 贵州人民出版社1993年版。

《晚清兵志》 （内包括《淮军志》、《甲癸练兵志》、《陆军志》、《海军志》、《军事教育志》、《兵工厂志》系列著作） 中华书局1997年至1999年出版。